O Conselho Geral do Agrupamento de Escolas Gil Eanes, constituído em 18 de maio de 2016, repudia todas as formas de coação, veladas e explícitas, de que possa ser alvo. A bem do interesse de todos os grupos que neste órgão se fazem representar, o Conselho Geral afirma a sua isenção e vontade de contribuir para uma escola melhor e sempre transparente nas suas decisões.